nanna2 Das scheint mir ein bekanntes Problem zu sein (https://github.com/inkstitch/inkstitch/issues/565) und hat anscheinend mit der Stickrahmengröße zu tun.
Ink/Stitch berechnet die Größe (bzw. den Mittelpunkt) momentan anscheinend fehlerhaft, da einfach von der Dokumentgröße ausgegangen wird und nicht von der Designgröße. Janome Stickmaschinen scheinen damit nicht so wirklich glücklich zu sein.
Eine mögliche Lösung für den Moment wäre dementsprechend, vor dem Abspeichern der Datei die Dokumentgröße an die Designgröße anzupassen.
Datei > Dokumenteinstellungen > Ändern der Seitengröße auf Inhalt... > Seitengröße auf Zeichnungs-/Auswahlgröße
Behebt das dein Problem?